Метагеномное секвенирование (mNGS) — это современный метод, позволяющий анализировать все микробные сообщества в образце, не ограничиваясь только определёнными группами организмов, как это делается в случае с методом 16S рРНК. Этот метод дает возможность получить полную картину микробного разнообразия и функциональности в различных средах. Результаты могут показывать наличие патогенных, условно-патогенных и полезных микроорганизмов. Анализ разнообразия микроорганизмов в образце может дать информацию о состоянии микробиома. Высокое разнообразие обычно связано с хорошим состоянием здоровья, тогда как низкое разнообразие может указывать на дисбаланс. Способность обнаруживать все потенциальные патогены в образце делает метагеномное секвенирование следующего поколения мощным инструментом в диагностике заболеваний.
Симптомы
Оценка состояния здоровья
-
Для бактериологических исследований собирается только свежевыделенный кал в специальную стерильную емкость (пластиковый контейнер с ложечкой).
-
Для получения достоверного результата материал для исследования берется до начала антибактериальной терапии или в интервалах между курсами лечения, но не ранее двух недель после ее окончания.
-
За 3-4 дня до исследования необходимо отменить прием слабительных препаратов, касторового и вазелинового масла и прекратить введение ректальных свечей.
-
Женщинам исследование (процедуру взятия урогенитального мазка) рекомендуется производить до менструации. Накануне исключить половые контакты. Взятие материала для исследования проводить до начала/противомикробной/антимикотической терапии или не ранее чем через 12-72 часа после прекращения этиотропного лечения. Материал забирается не ранее чем через 48 часов после интравагинального УЗИ- исследования и/или кольпоскопии. За 24 часа отменить (по согласованию с лечащим врачом) спринцевания и другие местные лечебные средства (мази, свечи), не использовать вагинальные контрацептивы (включая презервативы). Накануне взятия – проводить туалет без использования средств интимной гигиены (гелей, мыла и т.д.), проводить гигиенические процедуры половых органов необходимо теплой водой. Взятие материала производится не ранее чем через 2-4 часа после мочеиспускания.
-
Мужчинам для процедуры взятия урогенитального мазка рекомендуется исключить местное применение антисептиков и/или антибактериальных и противогрибковых препаратов в течение двух недель до исследования. В течение 3 часов до исследования удержаться от мочеиспусканий, не проводить туалет наружных половых органов. У мужчин при наличии выделений из уретры поверхность головки и область наружного отверстия уретры должны быть очищены с помощью марлевого тампона и крайняя плоть отведена назад для предупреждения контаминации
-
Оптимальное время для процедуры взятия крови – с 7:30 до 11:00.
-
За сутки до исследования придерживаться сложившегося повседневного рациона питания. Не рекомендуется излишнее потребление продуктов одного типа: только мясо, только овощи и .т.д.
-
За 24 часа до взятия крови исключить:
-
физические и эмоциональные перегрузки
-
авиаперелеты
-
температурные воздействия (посещение бань и саун, переохлаждение и т. д.)
-
нарушение режима «сон-бодрствование»
-
употребление алкоголя
-
инструментальные медицинские обследования (УЗИ, рентген и др.) или процедуры (физиотерапия, массаж и др.).
-
Не менее, чем за 8- 12 часов (но не более 14 часов) до взятия крови отказаться от приема пищи и напитков, за исключением питьевой воды.
-
За 1 час до взятия крови не курить.
-
Перед взятием крови необходимо пребывание в состоянии покоя не менее 20 минут.
-
При подготовке к взятию крови на фоне медикаментозной терапии прием или отмену лекарственных препаратов следует согласовывать с лечащим врачом.
-
При контроле показателя в динамике необходимо сдавать кровь в аналогичных условиях.
Сбор биоматериала
Взятие крови производится в пробирку с ЭДТА (фиолетовая крышка) 4 мл.
Закрытую пробирку с кровью сразу после взятия несколько раз плавно перевернуть вверх дном, чтобы кровь в пробирке с антикоагулянтом тщательно перемешалась. После плавного перемешивания пробирку поместить в штатив.
Хранение и транспортировка
Кровь
- При температуре 2–8 °С — в течение 5 суток;
- При температуре от –24 до –16 °С — в течение 3 месяцев;
- При температуре не выше –68 °С — длительно. Допускается однократное замораживание– оттаивание материала.
Кал
-
- При температуре 2–8 °С — в течение 5 суток;
- ! ВАЖНО! Не заполняйте пробирку до краев, большое количество биологического материала в образце может привести к неверным результатам! Так как количество консерванта может не хватить для всего объема каловых масс, и в результате во время транспортировки нарушится бактериальный состав.
Мазок из влагалища
- При температуре 2–8 °С — в течение 5 суток;
Мазок из цервикального канала
- При температуре 2–8 °С — в течение 5 суток;
Формат выдачи результата
Качественный
Состав
Комплексное исследование микробиома человека(Микробиота включает в себя бактерии, археи, грибы, простейшие, вирусы)